Taudinpurkaukset tautien seurannassa datatieteen kontekstissa (MOOD)

Ilmastonmuutoksen, eläinten ja ihmisten liikkuvuuden, väestönkasvun ja kaupungistumisen aiheuttamassamuuttuvassa ympäristössä uusien ja eksoottisten patogeenien syntymisen riski on kasvanut. Kansanterveysviranomaiset, joiden tehtävänä on suojella kansalaisia tartuntatautiepidemioilta, luottavat tyypillisesti terveydenhuollon tarjoajien virallisiin raportteihin tietyistä taudeista (indikaattoripohjainen seuranta tai IBS). He käyttävät kuitenkin yhä enemmän tapahtumaperusteista valvontaa, jossa hyödynnetään raportteja, tarinoita, huhuja ja muuta tietoa, jota välitetään virallisten tai epävirallisten kanavien, kuten blogien, vihjelinjojen ja sosiaalisen median, kautta. EBS: n etuna on sen oikea-aikaisuus, koska se heijastaa tapahtumia ennen kuin monet potilaat ovat käyneet terveydenhuollon tarjoajissa tai saaneet positiivisia testituloksia.

EU:n rahoittamassa MOOD-hankkeessa hyödynnetään tiedonlouhintaa ja massadatan analysointia EBS:n hyödyllisyyden parantamiseksi. Tietenkään se ei olisi täydellinen ilman verkkoalustaa, joka on suunniteltu edistämään rutiinikäyttöä, mahdollistamaan reaaliaikainen analysointi ja parantamaan tiedonkeruuta ja tulkintaa. MOOD-hankkeen tavoitteena on valjastaa tiedonlouhinta- ja analyysitekniikat useista lähteistä peräisin olevaan massadataan, jotta voidaan parantaa uusien tautien havaitsemista, seurantaa ja arviointia Euroopassa. Tätä varten MOOD perustaa kehyksen ja visualisointialustan, joka mahdollistaa epidemiologisten ja geneettisten tietojen reaaliaikaisen analysoinnin ja tulkinnan yhdessä ympäristöön liittyvien ja sosioekonomisten kovariaattien kanssa integroidussa monialaisessa, tieteidenvälisessä ja yhteinen terveys -lähestymistavassa:

1. tiedonlouhintamenetelmät heterogeenisen massadatan keräämiseksi ja yhdistämiseksi;
2. tautiasiantuntijoiden verkosto tautien puhkeamisen aiheuttajien määrittelemiseksi;
3. massadataan sovelletut data-analyysimenetelmät tautien ilmaantumisen ja leviämisen mallintamiseksi;
4. Loppukäyttäjille eli kansallisille ja kansainvälisille kansanterveyden ja eläinlääkinnän alan organisaatioille tarkoitettu käyttövalmis verkkoalusta, joka on räätälöity niiden tarpeisiin ja jota täydennetään valmiuksien kehittämisellä ja tautiasiantuntijoiden verkostolla havaittujen signaalien riskinarvioinnin helpottamiseksi.

MOOD-lähtö suunnitellaan ja kehitetään yhdessä loppukäyttäjien kanssa, jotta varmistetaan niiden rutiininomainen käyttö MOODin aikana ja sen jälkeen. Niitä testataan ja hienosäädetään ilma-, vektori- ja vesivälitteisten mallitautien, myös mikrobilääkeresistenssin, varalta. Loppukäyttäjien laajat kuulemiset, tietojen jakamisen, levittämisen ja koulutuksen esteitä koskevat tutkimukset sekä MOOD-tuotoksen kustannustehokkuutta koskevat tutkimukset tukevat kestävää käyttöönottoa tulevaisuudessa.