Exclusion of liability

This translation is generated by eTranslation, a machine translation tool provided by the European Commission.

Website experience degraded
We are currently facing a technical issue with the website which affects the display of data. The full functionality will be restored as soon as possible. We appreciate your understanding. If you have any questions or issues, please contact EEA Helpdesk (helpdesk@eea.europa.eu).

Infections par E. coli productrices de toxines

La bactérie Escherichia coli productrice de Shigatoxine (STEC, également connue sous le nom d’E. coli productrice de verocytotoxines (VTEC) ou E. coli entérohémorragique (EHEC)), est un groupe d’agents pathogènes zoonotiques (c’est-à-dire provenant d’animaux) qui causent des diarrhées ou des maladies plus graves après l’ingestion d’aliments ou d’eau contaminés, ou après contact avec des animaux infectés (Vanaja et al., 2013). En Europe, le STEC figure parmi les quatre causes les plus courantes de maladies d’origine alimentaire, à côté de la campylobactériose et de la salmonellose (ECDC, 2021). Les fortes précipitations plus fréquentes et l’augmentation de la température à l’avenir créent des conditions optimales pour la croissance bactérienne, la survie et la propagation, et augmentent le risque d’infection lié au STEC.

 

Source & transmission

Les bactéries E. coli sont présentes dans les intestins sains des humains et des animaux (y compris les bovins, les moutons, les chèvres, ainsi que les cerfs et les wapitis). Pourtant, le STEC présente des risques de contamination alimentaire lorsque les fèces animales ne sont pas manipulées hygiéniques. Déjà à un nombre relativement faible, le STEC peut causer des symptômes de maladie (Pacheco et Sperandio, 2012).

Les infections STEC, comme d’autres infections par la bactérie E. coli, sont souvent contractées lors de la traite ou de l’abattage, en particulier lors de la manipulation du bétail, ou pour les enfants dans les zoos de carnage. Outre les infections par contact direct, la transmission d’origine alimentaire est fréquente puisque les bactéries peuvent être présentes dans les produits alimentaires crus ou insuffisamment chauffés, tels que le lait cru et le fromage, ainsi que dans la viande crue ou mal cuite. De plus, les fruits et légumes crus peuvent être contaminés par STEC, après contact avec des fèces de bovins ou de l’eau ou du sol contaminés. Indirectement, le contact avec les mains contaminées, les ustensiles, les surfaces de travail de cuisine ou les couteaux, et la contamination croisée dans les aliments prêts à manger sont également des voies possibles pour l’infection. En outre, le contact humain-humain peut également causer des infections, même avec une très faible présence bactérienne (OMS, 2022; CDC, 2022).

Effets sur la santé

Les symptômes STEC surviennent généralement entre 2 et 10 jours après l’ingestion de la bactérie et provoquent principalement des problèmes gastro-intestinaux allant de la diarrhée sanglante légère à sévère, qui est souvent associée à des crampes abdominales, des nausées, des vomissements, de la fièvre ou de la colite hémorragique (HC). HC provoque de graves diarrhées sanglantes plusieurs jours après l’apparition des symptômes initiaux (Cohen et Gianella, 1992), et le syndrome urémique hémolytique (HUS) peut alors se produire. Dans 5 à 7 % des infections STEC, le patient souffre de SHU, ce qui est particulièrement risqué pour les jeunes enfants, les personnes âgées ou les personnes à faible immunité qui peuvent développer des complications graves (Pacheco et Sperandio, 2012). Dans ces cas, les vaisseaux sanguins, les globules rouges et les reins peuvent être endommagés, ce qui peut endommager de façon permanente le système nerveux et d’autres organes tels que le pancréas et le cœur (Pacheco et Sperandio, 2012).

Morbidité & mortalité

Dans les pays membres de l’EEE (à l’exclusion de la Suisse et de Türkiye en raison de l’absence de données), au cours de la période 2007-2021:

  • 71,539 infections et un taux global de notification de 2,2 cas pour 100000 habitants en 2021
  • Probabilité modérée d’hospitalisation (30-40 % de tous les cas ayant un statut d’hospitalisation connu)
  • 186 décès ont été signalés et un taux de mortalité d’environ 0,25 %. Cependant, pour les infections qui progressent vers le SHU, le taux de mortalité augmente jusqu’à 0,6-5 %
  • Tendance à l’augmentation de l’incidence depuis 2007, peut-être en partie en raison d’une sensibilisation accrue et d’une modification des diagnostics. En 2020, le nombre de cas signalés a diminué, probablement en raison de la pandémie de COVID-19 et d’une éventuelle sous-déclaration.
  • La plupart des cas de STEC étaient sporadiques, mais des épidémies se produisaient chaque année. Au printemps 2011, une souche STEC agressive a provoqué deux épidémies en Europe, touchant environ 4000 personnes dans 16 pays, l’Allemagne enregistrant le plus grand nombre de cas. L’éclosion a entraîné environ 900 cas de SHU et 50 décès (Foley et coll., 2013; Grad et al., 2012).

(ECDC, 2016-2022; ECDC, 2023)

Répartition entre la population

  • Groupe d’âge ayant la plus forte incidence de maladie en Europe: 0-4 ans (ECDC, 2016-2022)
  • Groupes à risque d’infection grave (y compris le SHU): jeunes enfants, personnes âgées et personnes à faible immunité

 

Sensibilité au climat

Caractéristiques climatiques

Les bactéries E. coli sont parfaitement adaptées aux conditions dans les intestins animaux. Ils peuvent croître à des températures comprises entre 7 et 50 °C, avec la température optimale à 37 °C (OMS, 2022). Les bactéries E. coli peuvent également survivre en dehors de leur hôte, par exemple, dans l’eau ou le sol à des températures aussi basses que 4 °C pendant plusieurs jours à plusieurs mois (Son et Taylor, 2021). Les souches d’E. coli productrices de toxines, comme la STEC, ont une capacité de survie légèrement inférieure car la production de toxines nécessite de l’énergie et a donc un coût de conditionnement physique (van Elsas et al., 2011).

Saisonnalité

En Europe, plus d’infections surviennent entre juin et septembre (ECDC, 2016-2022).

Impact sur le changement climatique

L’augmentation des phénomènes météorologiques extrêmes pourrait optimiser les conditions de croissance bactérienne, y compris celle de E. coli (produisant de lashigatoxine). Les fortes pluies provoquent plus de ruissellement des terres agricoles, ce qui entraîne des agents pathogènes du compost et des fèces animales et les inondations et un ruissellement accru augmentent le risque de débordement des égouts et de contamination des eaux de surface. En outre, les peuplements d’eau faibles pendant les périodes de sécheresse augmentent les concentrations d’agents pathogènes dans l’eau restante en raison d’une dilution moindre et d’une capacité de filtration moindre du sol (Lightfoot et al., 2007; Alegbeleye et Sant’Ana, 2020). Les bactéries E. coli sont capables de bien s’adapter aux climats plus chauds et, en particulier, certaines souches STEC sont très persistantes dans l’environnement (van Elsas et al., 2011). De plus, des températures de l’air plus élevées accélèrent la croissance bactérienne, par exemple dans le lait non pasteurisé s’il n’est pas stocké correctement à basse température. Étant donné que la consommation de lait cru est particulièrement élevée en Italie, en Slovaquie, en Autriche et en France, le nombre d’infections à E. coli, y compris celles avec STEC, devrait augmenter en raison du réchauffement climatique dans ces pays (Feliciano, 2021). Au contraire, l’augmentation prévue des températures des eaux de baignade froides au-dessus de 4 °C diminuera probablement les concentrations d’E. coli (Sampson et al., 2006).

 

Prévention et traitement

Prévention

    • Une bonne manipulation des aliments avant consommation, y compris le stockage (froid), le traitement thermique et la séparation pour éviter la contamination croisée (Uçar et al., 2016)
    • Pratiques sanitaires efficaces dans les cuisines et les ustensiles de cuisine (Ekici et Dümen, 2019)
    • Bonne hygiène sanitaire dans les exploitations agricoles et dans les abattoirs afin de minimiser la contamination fécale
    • Élimination fécale adéquate et réduction du contact avec le fumier d’animaux (Bauza et al., 2020)
    • Sensibilisation à la transmission des maladies
    • Probiotiques, c’est-à-dire des micro-organismes vivants et sûrs de Lactobacillus ou de Bifidobacterium (Allocati et al., 2013)

    Traitement

      • Pas de traitement spécifique
      • Réhydratation et remplacement d’électrolytes
      • Les médicaments antimicrobiens doivent être évités pour limiter le risque de développer un SHU
      • Dialyse (remplacement sanguin), thérapie spécifique à un organe et analgésiques puissants en cas de HUS (Bitzan, 2009)

       

      Liens vers de plus amples informations

       

      Références

      Alegbeleye, O. O. et Sant’Ana, A. S., 2020, Les agents pathogènes transmis par le fumier comme source importante de contamination de l’eau_ Une mise à jour sur la dynamique de la survie et du transport des agents pathogènes ainsi que sur les stratégies pratiques d’atténuation des risques, International Journal of Hygiene and Environmental Health 227, 113524. https://doi.org/10.1016/j.ijheh.2020.113524

      Allocati, N. et al., 2013, Escherichia coli en Europe: An Overview, International Journal of Environmental Research and Public Health 10 (12), 6235-6254. https://doi.org/10.3390/ijerph10126235

      Bauza, V. et al., 2020, Pratiques de gestion des excréments d’enfants et contamination fécale: Une étude transversale dans les zones rurales d’Odisha, Inde, Science of the Total Environnent 709, 136–169. https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2019.136169.

      Bitzan, M., 2009, Options de traitement pour HUS secondaire à Escherichia coli O157:H7, Kidney International 75, S62–S66. https://doi.org/10.1038/ki.2008.624

      CDC, 2022, page d’accueil d’E. coli, Centers for Disease Control and Prevention. Disponible à l’ adresse https://www.cdc.gov/ecoli/general/index.html. Dernière consultation en août 2022.

      Cohen, M. B. et Gianella, R. A., 1992, colite hémorragique associée à Escherichia coli O157:H7, Advances in Internal Medicine 37, 173–195. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/1557995/

      ECDC, 2016-2022, Rapports épidémiologiques annuels pour 2014-2020 — infection à Escherichia coli (STEC/VTEC) productrice de toxine shiga/ verocytotoxine. Disponible à l’ adresse https://www.ecdc.europa.eu/en/escherichia-coli-ecoli/surveillance-and-disease-data. Dernière consultation en août 2023.

      ECDC, 2023, Atlas de surveillance des maladies infectieuses. Disponible à l’ adresse https://atlas.ecdc.europa.eu/public/index.aspx. Dernière consultation en août 2023.

      EFSA et ECDC, 2022, The European Union One Health 2021 Zoonoses Report, EFSA Journal 20(12), 7666. https://doi.org/10.2903/j.efsa.2022.7666

      Ekici, G. et Dümen, E., 2019, Escherichia coli et sécurité alimentaire, dans: Starčič Erjavec, M. (éd.), The Universe of Escherichia coli, IntechOpen. https://doi.org/10.5772/intechopen.82375

      Feliciano, R., 2021, modélisation probabiliste de la concentration d’Escherichia coli dans le lait cru par temps chaud, Food Research International 149, 110679. https://doi.org/10.1016/j.foodres.2021.110679

      Foley, C. et al., 2013, Éclosion d’Escherichia coli O104:H4 Infections associées à la consommation de germes-Europe et Amérique du Nord, mai-juillet 2011, Morbidity and Mortality Weekly Report 62(50), 1029-1031. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24352067/

      Grad, Y. H. et al., 2012, épidémiologie génomique des épidémies d’ Escherichia coli O104:H4 en Europe, 2011, Actes de l’Académie nationale des sciences 109(8), 3065-3070. https://doi.org/10.1073/pnas.1121491109

      Lightfoot, D. A. et al., 2007, Amélioration de la tolérance à la sécheresse des plantes transgéniques Zea mays qui expriment le gène glutamate déshydrogénase (GDHA) d’E. coli. Euphytica 156(1–2), 103–116. https://doi.org/10.1007/s10681-007-9357-y

      Pacheco, A. R. et Sperandio, V., 2012, toxine Shiga in enterohemorrhagic E.coli: Réglementation et nouvelles stratégies antivirulence, Frontiers in Cellular and Infection Microbiology 2(81). https://doi.org/10.3389/fcimb.2012.00081

      Sampson, R. W. et al., 2006, Effects of temperature and sand on E. coil survival in a Northern Lake water microcosm, Journal of Water and Health 4,(3), 389–393. https://doi.org/10.2166/wh.2006.524

      Son, M. S. et Taylor, R. K., 2021, Growth and Maintenance of Escherichia coli Laboratory Strains, Current Protocol 1(1), e20. https://doi.org/10.1002/cpz1.20.

      Uçar, A. et al., 2016, Sécurité alimentaire — Problèmes et solutions. Dans: Makun, H.A. (éd.), Significance, Prevention and Control of Food Related Diseases. https://doi.org/10.5772/60612

      Van Elsas, J. D. et al., 2011, Survie d’Escherichia coli dans l’environnement: Aspects fondamentaux et de santé publique, The ISME Journal 5(2), 173-183. https://doi.org/10.1038/ismej.2010.80

      Vanaja, S. K. et al., 2013, Enterohemorrhagic et autres Escherichia coli productrices de Shigatoxines. Dans: Donnenberg, M. S. (éd.), Escherichia coli (2sd Edition), Academic Press, pp. 121-182. https://doi.org/10.1016/B978-0-12-397048-0.00005-X

      OMS, 2022, Organisation mondiale de la santé, https://www.who.int/. Dernière consultation en août 2022.